Theo Luật thuế; chỉ có các loại mấy móc thiết bị sau đây mới không chịu thuế NK và thuế GTGT khâu nhập khẩu: :"Máy móc, thiết bị, vật tư thuộc loại trong nước chưa sản xuất được cần nhập khẩu để sử dụng trực tiếp cho hoạt động nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ; máy móc, thiết bị, phụ tùng thay thế, phương tiện vận tải chuyên dùng và vật tư thuộc loại trong nước chưa sản xuất được cần nhập khẩu để tiến hành hoạt động tìm kiếm, thăm dò, phát triển mỏ dầu, khí đốt; tàu bay, dàn khoan, tàu thuỷ thuộc loại trong nước chưa sản xuất được cần nhập khẩu làm tài sản cố định của doanh nghiệp, thuê của nước ngoài sử dụng cho sản xuất, kinh doanh và để cho thuê".
Như vậy, trường hợp bạn "NK máy công trình đã qua sử dụng từ Nhật Bản về Việt Nam " để bán hoặc để sử dụng cũng phải nộp thuế nhập khẩu và thuế GTGT khâu NK thường là 10%.
Tuy nhiên, thuế NK được tính vào giá trị tài sản, sẽ được đưa vào chi phí hợp lý (khấu hao); còn thuế GTGT sẽ được khấu trừ ngay sau đó. Mặt khác, thuế suất thuế nhập khẩu thiết bị này cũng khá thấp.
Xem thêm http://www.customs.gov.vn